Des génomes dynamiques à haute plasticité sont nécessaires pour permettre aux agents pathogènes, principalement des bactéries, de survivre dans des environnements changeants. Avec l'aide de méthodes de séquençage à haut débit et de technologies in silico, il est possible de révéler, comparer et cataloguer plusieurs de ces événements génomiques dynamiques. La diversité génomique est importante lors de la détection et du traitement d'un pathogène, car ces événements peuvent modifier le service et la constitution de l'agent pathogène. Il est nécessaire d'analyser plus d'une seule concaténation génomique d'une espèce pathogène pour comprendre les mécanismes pathogènes. La génomique comparative est une méthodologie qui permet aux scientifiques de comparer les génomes d'espèces et de souches disparates. Il existe plusieurs exemples d’études génomiques comparatives réussies, parmi lesquels l’examen de Listeria et Escherichia coli. Certaines études ont tenté de faire la différence entre les microbes pathogènes et non pathogènes. Cette enquête s'avère difficile, même si, car une seule espèce bactérienne peut avoir plusieurs souches et le contenu génomique de chacune de ces souches varie.
Image 383A | Une puce microarray contient du DNA (ADNc) complémentaire à de nombreuses séquences d'intérêt. L'ADNc devient fluorescent lorsqu'il s'hybride avec un fragment DNA correspondant dans l'échantillon. | Institut national du cancer / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Microarray_Comparative_Genomic_Hybridisation.jpg) de Wikimedia Commons
Auteur : Merim Kumars
Références:
Microbiologie médicale II: stérilisation, diagnostic de laboratoire et réponse immunitaire
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