La cartographie de restriction est une stratégie descendante qui divise un objectif chromosomique en régions plus fines. Les enzymes de limitation sont utilisées pour digérer un chromosome et produire un ensemble ordonné de fragments DNA. Il s'agit de fragments génomiques de l'objectif à la place de fragments clones dans la bibliothèque. Ils seront épinglés à des sondes de la bibliothèque génomique qui sont choisies au hasard pour l'objectif de détection. Les longueurs des fragments sont mesurées par electrophoresis, qui permet de déduire leur distance le long de la carte en fonction du site de limitation, les marqueurs d'une carte physique. Le progrès implique des algorithmes combinatoires.
Au cours de la progression, un chromosome est obtenu à partir d'une cellule hybride et coupé à un site de limitation rare pour produire de gros fragments. Les fragments seront séparés par taille et subiront hybridization, formant la carte de macrorestriction et des blocs contigus distincts (ie Contigs). Pour s'assurer que les fragments sont liés, des clones de liaison avec les mêmes sites de coupe rares au niveau des grands fragments peuvent être utilisés.
Image 240A | Présentation du flux de travail Perturb-seq | Sdlee94 / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Overview_of_Perturb-seq_workflow.jpeg) from Wikimedia Commons
Auteur : Milos Pawlowski
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