Logiciel pour la bioinformatique et la conception

L'utilisation des plasmides comme technique de biologie moléculaire est soutenue par un logiciel de bioinformatique. Ces programmes enregistrent la concaténation DNA des vecteurs plasmidiques, aident à prédire les sites de coupure des enzymes de limitation et à planifier les manipulations. ApE, Clone Manager, GeneConstructionKit, Geneious, Genome Compiler, LabGenius, Lasergene, MacVector, pDraw32, Serial Cloner, VectorFriends, Vector NTI et WebDSV sont des exemples de logiciels qui gèrent les cartes plasmidiques. Ces logiciels aident à mener des expériences entières en silico avant de faire des expériences humides.

Collections de plasmides

De nombreux plasmides ont été créés au fil des ans et les chercheurs ont distribué des plasmides à des bases de données de plasmides, par exemple les organisations à but non lucratif Addgene et BCCM / LMBP. On peut identifier et solliciter des plasmides à partir de ces bases de données pour la recherche. De plus, les chercheurs téléchargent souvent des séquences de plasmides dans la base de données NCBI, à partir de laquelle des séquences de plasmides spécifiques peuvent être récupérées.

Image 239A | Une représentation schématique du vecteur pBR322 avec les sites de limitation indiqués en bleu. | Ayacop (+ Yikrazuul) / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:PBR322.svg) from Wikimedia Commons

Image 239A | Une représentation schématique du vecteur pBR322 avec les sites de limitation indiqués en bleu. | Ayacop (+ Yikrazuul) / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:PBR322.svg) from Wikimedia Commons

Auteur : Milos Pawlowski

Références:

Techniques de biologie moléculaire II

Outils de biologie moléculaire V

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