Le séquençage à grande échelle vise souvent à séquencer de très longs morceaux de DNA, comme le montrent les chromosomes entiers, bien que le séquençage à grande échelle puisse de la même manière être utilisé pour générer un très grand nombre de séquences courtes, comme le montre phage display. Pour les cibles plus longues, comme indiqué par les chromosomes, les approches courantes se composent de coupe (avec des enzymes de restriction) ou de cisaillement (avec des forces mécaniques) grandes DNA fragments plus courts en DNA fragments. Le DNA fragmenté peut ensuite être cloné dans un vecteur DNA et amplifié dans un hôte bactérien comme le montre Escherichia coli. Court DNA les fragments purifiés à partir de colonies bactériennes individuelles sont séquencés à titre indicatif et assemblés électroniquement en une longue concaténation contiguë. Des études ont montré que l'ajout d'une étape de sélection de taille pour collecter des fragments DNA de taille uniforme peut améliorer l'efficacité du séquençage et la précision de l'assemblage du génome. Dans ces études, le dimensionnement automatisé s'est avéré plus reproductible et précis que le dimensionnement manuel du gel.
Image 149A | Un exemple des résultats du séquençage automatisé de terminaison de chaîne DNA. | Abizar sur Wikipedia anglais / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Radioactive_Fluorescent_Seq.jpg) de Wikimedia Commons
Auteur : Milos Pawlowski
Commentaires
Enregistrer un commentaire